Der Einsatz von omics zur Beantwortung von Fragen aus der Praxis der Garnelenzucht

Die wichtigsten mikrobiellen Ökosysteme bei der Garnelenzucht sind das Wasser, der Boden und die Darmmikrobiota der Tiere. Lallemand Animal Nutrition hat probiotische Futterzusätze und Lösungen zur Bioremediation entwickelt, die eine Modulation der Mikrobiota von Darm und Wasser gezielt unterstützen. Was genau ist die Wirkung auf diese mikrobiellen Ökosysteme? Dank der Metagenomik helfen uns die kürzlich vom Lallemand Monogastric Center of Excellence durchgeführten Studien, einige Fragen aus der Praxis zu beantworten.

Versuchsaufbau

Wir haben in einem Brut- und Aufzuchtbetrieb in Vietnam einen Versuch mit Weißbeingarnelen (Litopenaeus vannamei) durchgeführt. Ziel des Versuchs war die Evaluierung der Verwendung eines Produkts zur Bioremediation des Wassers (LALSEA PL Pack, Lallemand Animal Nutrition) zusammen mit einem probiotischen Futterzusatz (BACTOCELL oder LALPACK PROBIO, Lallemand Animal Nutrition) im Vergleich zu einer prophylaktischen antibiotischen Behandlung des Wassers (in der Brutphase) und einer mikrobiellen Lösung des Wettbewerbs (für die Aufzuchtphase) sowie einer Negativkontrolle (Abbildung 1).

	Bioremediationsprodukte	Probiotika im Futter
	Brut (22 Tage, n = 6/Behandlung)/
Lallemand (LAL)	LALSEA PL PACK	BACTOCELL
Antibiotikum (ABX)	rezeptfrei (5ppm/Tag)	–
	Aufzucht (28 Tage, n = 4/Behandlung)
Lallemand (LAL)	LALSEA PL PACK	LALPACK PROBIO
Wettbewerber (COMP)	Wettbewerbsprodukt	Wettbewerbsprodukt
Kontrolle (CON)	Kein Produkt	Kein Produkt

Ergebnisse und Antworten

Dank der Verwendung der Amplikon-Sequenzierungstechnik war es möglich, die durch die unterschiedlichen mikrobiellen Lösungen erzielten Veränderungen in der Mikrobiota von Darm und Wasser sowie deren Auswirkungen auf die Leistungsparameter zu beurteilen. Die Anwendung dieser State-of-the-Art-Techniken der Genomik versetzte die Wissenschaftler in die Lage, praktische Fragen zum Mikrobiota-Management in der Garnelenzucht beantworten zu können:

• Wirkt sich das Mikrobiom des Wassers auf alle Lebensstadien der Garnelen gleich aus? Nein.

In den frühen Brut-Phasen ist die mikrobielle Population von Darm und Wasser sehr ähnlich, im Gegensatz zur Aufzuchtphase.

• Kann man die zugesetzten nützlichen Bakterien im Wasser und in der Garnele nachverfolgen? Ja. (Abbildung 2)

• Bewirken die probiotischen Produkte und jene zur Bioremediation eine Reduzierung der Prävalenz von unerwünschten Bakterien und eine Förderung der „guten“ Bakterien? Ja, und zwar sowohl in der Brut- als auch in der Aufzuchtphase.
• Wirken alle Probiotika und alle Produkte zur Bioremediation auf die gleiche Art und Weise? Nein.

Die Lösungen von Lallemand haben sich als wirksamer erwiesen, und zwar sowohl bei der Anreicherung des Darms mit nützlichen Mikroorganismen als auch bei der Reduzierung der relativen Menge an unerwünschten Bakterien. Dies unterstreicht die Wichtigkeit der Stammspezifität bei mikrobiellen Produkten.

• Wirkt sich das auf die Leistung aus? Ja.

Als Ergebnis der Verbesserung der Mikrobiota von Wasser und Darm zeigte sich bei der LAL-Gruppe im Vergleich zur COMP-Gruppe eine Verbesserung beim Endgewicht der Tiere, bei der Futterverwertung (FCR) und bei der Überlebensrate. In der LAL-Gruppe war eine bessere und gleichmäßigere Leistung zu beobachten.