31 Août 2021
Utilisation des «OMIQUES» pour répondre aux problématiques pratiques de l’élevage de crevettes
31 Août 2021

Les principales composantes microbiennes des systèmes d’élevage de crevettes sont l’eau, la terre et le microbiote intestinal de la crevette. Lallemand Animal Nutrition a mis au point des probiotiques alimentaires et des solutions de biorestauration visant à mieux cibler la modulation du microbiote intestinal et de l’eau, respectivement. Ces mesures permettent de garantir les résultats de l’élevage. Cependant, quel est leur impact réel sur ces écosystèmes microbiens ? Grâce à la métagénomique, de récentes études (menées par le Centre d’excellence Lallemand dédié aux monogastriques) nous ont aidé à répondre à nombre de questions pratiques que nous posent fréquemment les pénéiculteurs concernant les écloseries et les nurseries.
Conditions de l’essai
Nous avons réalisé un essai au Vietnam couvrant les phases d’écloserie et de nurserie de la crevette à pattes blanches (Litopenaeus vannamei). Cet essai avait pour but d’évaluer l’usage d’un produit de biorestauration de l’eau (Pack LALSEA PL, Lallemand Animal Nutrition) associé à un probiotique alimentaire (BACTOCELL ou LALPACK PROBIO, Lallemand Animal Nutrition) en comparaison avec une prophylaxie antibiotique de l’eau, pour la phase d’écloserie, et des solutions microbiennes concurrentes ou un témoin négatif, pour la phase de nurserie (Figure 1).
Figure 1 Aqua OMICS FU44
Produit de bioremediation | Probiotique dans l'aliment |
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![]() | Nurserie (22jours, n = 6/traitement)/ |
|
Lallemand (LAL) | PACK LALSEA PL | BACTOCELL |
Antibiotique (ABX) | OTC (5ppm/jour) | - |
![]() | Nurserie (28 jours, n = 4/traitement) |
|
Lallemand (LAL) | PACK LALSEA PL | LALPACK PROBIO |
Concurrence (COMP) | Produit concurrent | Produit concurrent |
Témoin (TEM) | Pas de produit | Pas de produit |
Réponses aux questions des pénéiculteurs
À l’aide de la technique métagénomique de séquençage d’amplicons, il a été possible d’évaluer les changements de microbiote intestinal des crevettes et de l’eau induits par les différentes solutions microbiennes appliquées, ainsi que l’impact sur les performances. Ici, l’application de techniques génomiques de pointe a permis aux chercheurs de répondre aux questions pratiques que se posent les pénéiculteurs quant au contrôle positif du microbiote :
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- Le microbiote de l’eau affecte-t-il de façon similaire toutes les étapes de vie de la crevette ? Non.
Durant les premières phases d’écloserie, les populations microbiennes de l’intestin et de l’eau étaient très similaires, ce qui n’était pas le cas durant la phase de nurserie.
- Est-il possible de déterminer les bactéries bénéfiques ajoutées dans l’eau et l’organisme de la crevette ? Oui. (Figure 2)
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- Les probiotiques et les produits de biorestauration réduisent-ils la prévalence des bactéries indésirables et améliorent-ils celle des bactéries bénéfiques ? Oui. aussi bien durant la phase d’écloserie que de nurserie
Tous les probiotiques et produits de biorestauration fonctionnent-ils de la même manière ? Non.
- Les probiotiques et les produits de biorestauration réduisent-ils la prévalence des bactéries indésirables et améliorent-ils celle des bactéries bénéfiques ? Oui. aussi bien durant la phase d’écloserie que de nurserie
Les solutions Lallemand se sont avérées plus efficaces dans l’enrichissement du microbiote intestinal de la crevette avec des groupes microbiens bénéfiques comme dans la réduction de la relative abondance des bactéries indésirables, par rapport aux autres solutions testées. Ces résultats soulignent l’importance de la spécificité des souches dans les produits microbiens.
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- Enfin, cela se traduit-il par une amélioration des performances ? Oui.
Du fait de l’amélioration du microbiote intestinal et de l’eau, le poids corporel, l’indice de consommation (IC) et le taux de survie étaient supérieurs dans le groupe LAL par rapport au groupe COMP, durant la phase de nurserie. Le groupe LAL a offert un meilleur rendement et des performances plus homogènes.
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