Mikrobiota oder Mikrobiom?

Vor einem Jahrzehnt noch unbekannt in der Öffentlichkeit, hat das Wort Mikrobiom in den letzten zehn Jahren die Massenmedien erreicht. Heute ist es in aller Munde. Aber was bedeutet es? Sind Mikrobiom und Mikrobiota Synonyme?

Nicht wirklich!

Die Mikrobiota ist die Sammlung von mikrobiellen Organismen innerhalb einer Gemeinschaft, typischerweise verwendet in Bezug auf einen tierischen Wirt. Sie bezieht sich auf die Taxonomie (Name) der vorhandenen Mikroorganismen. Am gebräuchlichsten ist die Verdauungsmikrobiota.

Das Mikrobiom ist die Sammlung von Mikroorganismen und ihren Genen, die in einer bestimmten Umgebung leben. Es bezieht sich auf die Bakterien (primär) und ihre Gene (sekundär). Das Mikrobiom enthält sowohl die Mikrobiota, ihre «Aktivität» als auch die umgebenden Umweltbedingungen (Berg, et al., 2020).

Die Metagenomik ist die Wissenschaft, die mit modernen Mikrobiota-Studien verbunden ist. Es ist die Untersuchung der kombinierten Genome einer Gemeinschaft von Mikroorganismen, des Metagenoms. Im Gegensatz zu traditionellen, auf Kulturen basierenden mikrobiellen Studien beinhaltet die Metagenomik Hochdurchsatz-Sequenzierung und Bioinformatik-Tools. Sie ermöglicht eine bessere Beschreibung der mikrobiellen taxonomischen Vielfalt und der potenziellen biologischen Funktionen, die von der gesamten Gemeinschaft getragen werden.